大学を卒業し、システムエンジニアとなった輝山工祐(きやまこうすけ)。しかし、そこは彼が思い描いていた開発環境ではなかった。失意と妥協の中、同僚・優加(やさか)から持ちかけられたゲーム制作共同計画に難色を示す輝山だったが……6年にわたり繰り広げられてきた裸族忍者シリーズも今作にてついに完結!